En 1967, la sustentación de la tesis titulada “Equilibrio Líquido-Vapor de la mezcla Etanol-Benceno-Cloroformo” de Enrique Becerra marcó el inicio del campo de investigación en termodinámica del PEQ.   Rápidamente se trazaron los contornos de la línea de investigación en termodinámica aplicada, cuyas actividades tuvieron un crecimiento significativo en la década de los 70, con la creación del Laboratorio de Propiedades Termodinámicas.  Después de un periodo de receso, la investigación en el área fue retomada con la creación del Laboratorio de Termodinámica Aplicada, rebautizado después como Laboratorio de procesos de Separación, que funciona actualmente en asociación con la Petrobras.